桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类方法及其应用
申请号:201710064068X
摘要:本发明公开了一种桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑葚病果;提取桑葚病果的总DNA;Illumina?DNA文库构建;Illumina高通量测序;去除测序数据中桑树基因组序列;组装微生物基因组序列;组装完整核糖体DNA序列;筛选标记微生物核糖体DNA序列;对比分析核糖体DNA序列进行种属分类,实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示,运用本发明方法对桑葚菌核病病原菌进行鉴定及种属分类,共鉴定出3种真菌,其中相对丰度最高的为Ciboria属病原菌,据此确定桑肥大性菌核病病原菌为Ciboria,并根据比对结果,确定其为Ciboria?carunculoides;该属大多数为植物病原菌,可导致植物的果实、种子出现僵化、膨大等症状,与研究的桑葚菌核病的病征相符合。
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